同等学力申硕在职研究生属于学位教育，获得硕士学位单证;非全日制研究生属于学历教育，获得学位和学历双证。两者主要有以下区别：
1、报考方式
同等学力申硕：先学习后考试，没有入学考试，后期参加申硕考试即可。
非全日制研究生：先参加入学考试，通过考试入学，毕业获得硕士学位和学历。
2、考试难度
同等学力申硕：考试科目是外国语和学科综合两门，满分都是100分，为合格制，达到60分可以通过考试。
非全日制研究生：有初试和复试，初试科目国家统一命题，复试科目学校自命题，属于淘汰制，择优录取，分数线不定。
3、报考条件
同等学力申硕：虽然允许专科和本科无学位人员报考，但申硕需要本科学士学位满3年。
非全日制研究生：允许专科生报考，本科也五学位要求，看具体专业，有的需要满足一定的工作经验才可报考。
4、获得证书
同等学力申硕：获得课程结业证书和硕士学位证书，结业证书国家不承认，学位国家承认。
非全日制研究生：获得硕士学位和研究生学历，都是国家承认的证书，与全日制具有同等法律效力、法律地位。
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