概念不同
同等学力：是国家计划内，以在职人员的身份，部分时间在职工作，部分时间在校学习的研究生学历教育的一种类型;属于国民教育系列。在报名、考试要求及录取办法方面不同种类有所不同，是经过学校录取的正式研究生，获得与脱产相同的研究生毕业的学位。同等学力硕士研究生最初出现的目的，是在现行的向毕业研究生授予学位的渠道之外，对那些学术水平或专门技术水平已达到所申请学位专业的毕业研究生同等水平的人的一种认可。
专业硕士：专业硕士是我国研究生教育的一种形式。根据国务院学位委员会的定位，专业学位为具有职业背景的学位，培养特定职业高层次专门人才。
专业不同
同等学力申请硕士学位所获得的学位为与全国统招硕士学位相同，为学术型学位(Academic degree)，如工学、理学、管理学、经济学、金融学等
专业学位为应用型学位(Professional degree)，一般为专业领域硕士学位，如工程硕士、教育硕士、会计硕士等。
入学方式不同
同等学力申请硕士学位没有入学考试，可以先参加课程学习，培养方案与全国统招硕士培养方案相同，在学习过程中参加全国外语考试，部分专业还要参加专业综合考试，每年组织一次，可连续参加四次考试。
专业硕士需要先参加国家统一组织的入学考试，录取后参加学习。
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