课程体系设置既注重基础理论与工程实践能力培养相结合，又要符合“三师人才”的培养定位，同时还要满足执业资格认证的需求。因此，在建筑与土木工程在职研究生课程体系设置中，以专业基础和实践应用类课程为主体，人文社会科学类课程为有益补充，同时开设提高学生实践能力及与职业资格认证相关的课程。
建筑与土木工程在职研究生课程体系包括综合素质教学模块、专业基础教学模块、“三师人才”特色模块、案例教学模块及专业创新实践教学模块。
(1)综合素质模块。由“英语”、“工程技术哲学”、“执(职)业道德与素养”以及“《公司法》及创业导论”四门课程组成，除“《公司法》及创业导论”外，均为必修课程。旨在提高建筑与土木工程在职研究生的综合素养。
(2)专业基础教学模块。结合建筑与土木工程在职研究生的研究方向，专业基础教学模块主要由“混凝土结构理论与应用”、“钢结构理论与应用”、“基础工程及应用”、“结构动力学及应用”等土木工程学科的基础理论课程组成，是土木工程学科的平合课程。该模块要求建筑与土木工程在职研究生系统掌握土木工程学科所必需的结构、力学、材料等基本原理和方法，为后续三个模块的学习和毕业后继续学习提供坚实的基础。
(3)“三师人才”特色模块。根据土木工程设计、建造、使用管理三个阶段对人才的需求，结合学校的办学优势和特色，专门设置了“三师人才”特色教学模块。其中:工程设计师方向的研究生要求必须选修“工程结构抗震学”、“工程结构软件”、“工程结构概念设计”三门特色课程，通过对抗震设防、概念设计、各种设计软件等知识的学习，要求研究生基本掌握工程设计的流程及设计环节关键点、技术难点的解决方法;工程建造师方向的研究生通过选修“土木工程施工新技术”、“施工安全控制技术”两门特色课程，掌握工程建造的最新技术及安全控制要点;而“工程结构检测”、“工程事故分析与处理”、“既有结构可靠性评定”贝{J是专门针对工程检测评估师方向开设的，通过对上述三门课程的学习，要求建筑与土木工程在职研究生能够熟练掌握新建建筑的检测、工程事故处理及既有结构可靠性评定技术方法，为之后开展工程实践奠定理论基础。
(4)案例教学模块。由“结构工程案例教学”、“岩土工程案例教学”、“桥梁与隧道工程案例教学”、“土木工程建造与管理案例教学”四门课程组成。重点通过分析一定数量的典型工程案例、现场教学、模拟训练等，从基础设计、主体结构设计、施工建造、主体结构检测、既有结构可靠性评定等环节人手，详细讲解具体工程过程及技术难点的处理方法，使建筑与土木工程在职研究生能够将学到的土木工程基础理论与方法用到实际工程中，解决工程问题，达到学以致用的目的。
如“结构工程案例教学”课，从某项具体工程的建筑平面图开始，教授建筑与土木工程在职研究生进行有限元建模，完成复杂结构设计、计算，解决工程设计技术难点，并完成绘图及校对审核等工作。建筑主体竣工后，建筑与土木工程在职研究生要学习如何进行主体结构检测和竣工验收。在建筑使用过程中，如出现裂缝等损伤情况，建筑与土木工程在职研究生要掌握检测、评估的方法以及加固补强的基本措施。对于“岩土工程案例教学”课，结合具体的工程案例，使建筑与土木工程在职研究生掌握桩基础工程完整的设计流程、基坑支护的常规设计方法、岩土工程勘察全过程、勘察报告的撰写等。
(5)专业创新实践教学模块。专业创新实践教学模块，是指与专业实践和学位论文有关的教学活动，包括专业实践前的实践专题教学、专业实践的开展、文献阅读和学位论文选题等内容，是培养建筑与土木工程在职研究生专业技能和创新能力的重要环节。
除此之外，学校还围绕结构工程师、土木工程建造师、监理工程师、造价工程师、咨询工程师等注册执业考试所需的知识，一方面要求教师在授课时尽量融人相关知识点，另一方面还邀请相关专家来校做注册执业考试辅导报告，以提高建筑与土木工程在职研究生参加注册执业考试的积极性和通过率，促进建筑与土木工程在职研究生教育与相应职业资格认证的有效衔接。
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