科学性原则指的是在职博士就业教育必须要遵循科学规律。在职博士的就业教育作为一项综合性的教育实践活动，首先要遵循教育规律，如在职博士的就业教育受社会政治、经济和文化发展的制约并为社会政治、经济和文化的发展服务;就业教育受人的发展规律制约并为人的发展服务;其次要遵循人的心理发展规律，如人的思想活动总是以一定的心理活动为基础的，我们必须以在职博士的心理特点及其变化发展规律为依据，针对不同的年级、不同的对象、不同的群体，采取不同形式、不同方法，进行不同内容的就业教育指导活动;再次，我们开展在职博士就业教育，要借鉴和遵循西方一些有先进的就业指导理论，如马斯洛的需求论、类型学理论、生涯发展理论等等。
此外开展在职博士就业教育，还要保持科学的态度。在制定教育计划时既要研究教育对象的心理状态和心理活动规律及其实际需要，又要对教育计划的各项措施、手段、方法、内容等进行科学论证;在实施教育计划时，一方面要采取各种方法和手段，从不同方面对指导对象进行就业观念、就业心理、就业能力等全面综合的指导教育，另一方面要对教育计划进行校正和完善，从而提高就业教育的针对性和实效性。
由于在职博士相对于本科生思想上更加成熟，而且有些在职博士对于自身的职业发展有了一定的想法，这样使得在职博士的就业教育就业区别与本科生的就业教育。针对在职博士自身的特点，单方向的、课堂灌输式的教育方式是行不通的，我们要注重依托第二课堂，例如加强社会实践活动、开展丰富多彩的校园文化活动、开展就业指导系列讲座等形式来开展在职博士的就业教育，使在职博士就业教育更富实效。
